Ejecutamos el siguiente comando con permisos de administrador:
Para Deshabilitar el aviso:
reg add "HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Policies\Explorer" /f /v NoLowDiskSpaceChecks /t "REG_DWORD" /d 1
Para Habilitar el aviso:
reg add "HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Policies\Explorer" /f /v NoLowDiskSpaceChecks /t "REG_DWORD" /d 0
Y reiniciamos el ordenador.